cygwin  없이 된다고 해서 함 해봤는데 아직까지는 불안한게 있는가 봅니다.
ndk-build clean 명령어가 안먹길래 이것저것 해보다가 cygwin 설치 하니깐
잘되는군요 ~!! 그냥 cygwin에서 할렵니다.~!!


cygwin 없이 사용
C:\Android\android-ndk-r7-windows\android-ndk-r7\samples\hello-jni>ndk-build clean
Clean: hello-jni [armeabi]
make: *** [clean-hello-jni-armeabi] Error 1


cygwin  에서 
$ ndk-build clean
Clean: hello-jni [armeabi]
Clean: stdc++ [armeabi]