jni모듈을 서로 다른 두개의 모듈을 개발할 필요가 있어서 각각 1.so, 2.so라는 걸 만들었습니다. 
ndk-build를 이용하면 기본적으로 jni디렉토리 밑의 Android.mk를 찾게 되는데 두개의 모듈을 개발해야 해서 디렉토리 구조를 다음과 같이 했습니다. 

/TestProject/
---- /jni/
---- /lib1/
---- /lib2/

두개의 jni모듈을 빌드하기 위해서 root에 Application.mk를 만들어서 두개의 모듈을 명시해 주고 
ndk-build NDK_APP_APPLICATION_MK=Application.mk 옵션을 이용해서 빌드했습니다. 
정상적으로 빌드되었고 테스트도 했습니다. 
그런데 버그가 있어서 디버깅을 하려니 문제가 발생하네요. 
ndk-gdb에는 ndk-build에 있던 NDK_APP_APPLICATION_MK와 같은 옵션이 없네요. 
무조건 jni 밑의 Android.mk를 참조하려고 하는것 같네요. 

이런경우 어떻게 해야 하나요? 혹시 아시는 고수님들의 답변 부탁드립니다.